Im Mikroskopie-Labor stehen optische Mikroskope für verschiedene Techniken zur Verfügung, z. B. Hellfeld, Polarisationskontrast, Fluoreszenz. Die Mikroskope können auch mit den folgenden Kameras ausgestattet werden.

Wir haben auch die FlowCam 5000 von Yokogawa, ein Partikelanalysegerät, das optische Bilder aufnehmen kann. Es ist vergleichbar mit einem Durchflusszytometer und verfügt über eine Spritzenpumpe und eine 100 x 700 µm große Glaskapillare, durch die Flüssigkeit fließt. Während eines Probenlaufs werden mit einer Kamera Bilder des Flusses aufgenommen, die mit einem 10x-Objektiv vergrößert werden. Erkannte Partikel werden als Bilder in einer Collage zusammengestellt, die dann vom Benutzer anhand der von der Software bereitgestellten Partikeleigenschaften (z. B. Größenbeschreibung und Morphologie u. a.) gruppiert und klassifiziert werden können. Das Probenvolumen reicht von 0,25 bis 1 mL.